В конце фильма пленники-ассасины сбегают из лаборатории «Абстерго Индастриз». После этого они проникают на тайное собрание тамплиеров, где похищают Яблоко Эдема и скрываются в ночном городе.
Однако в первоначальном монтаже ничего этого не было. В ранней версии в комнату врывались охранники с арбалетами и расстреливали практически всех пленников. Сбежать удавалось только герою Майкла Фассбендера Каллуму Линчу. Создатели видели его в качестве главного героя в будущих фильмах серии. Только представьте, ассасин с уникальными способностями и невероятным опытом из прошлого остаётся одиночкой в современном мире!
Но на тестовых показах зрителям такая концовка показалась удручающей. Они ждали, что и другие пленники-ассасины смогут оказать достойное сопротивление. Мол, зачем на них столько времени потратили, если их всё равно расстреляли из арбалетов?